纯化水系统（Purified Water System）在制药、食品和饮料行业中至关重要，因为它们用于生产过程中。为了确保这些系统的卫生状态，防止微生物污染，通常会采用以下几种常见的灭菌方法。

     纯化水系统可以使用热水循环或者蒸汽进行灭菌。通常，这种方法涉及将系统加热到特定温度一段时间，例如80°C以上的热水循环数小时，或使用饱和蒸汽（121°C, 21psi）进行灭菌。

     UV灯可以安装在管道中，用来破坏水中的微生物DNA，从而抑制其繁殖。不过，UV照射不会去除已经存在的生物膜，因此通常与其他方法结合使用。

    臭氧是一种强氧化剂，能够有效杀灭细菌和其他微生物。它可以被注入水中，之后需要将残留的臭氧分解掉以保证水质安全。

    过氧化氢蒸汽是一种低温灭菌技术，适用于对热敏感的设备。它可以在较低温度下快速有效地杀死微生物，并且在完成灭菌后迅速分解为水和氧气，无毒害残留。

    包括但不限于次氯酸钠、氯胺等，可以通过加入化学消毒剂来清洗和消毒整个水系统。使用后必须彻底冲洗干净，以免影响产品质量。

    虽然严格来说不是一种“灭菌”方法，但超滤、纳滤或反渗透等精密过滤技术可以去除较大尺寸的微生物粒子，是保持水质纯净的重要手段之一。

    对于一些小型或者非连续运行的纯化水系统，定期排空并让系统干燥也是种有效的控制微生物生长的方法。